Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GFI1BQ5VTD9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GFI1BQ5VTD9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GFI1BQ5VTD9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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GFI1BQ5VTD9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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GFI1BQ5VTD9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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GFI1BQ5VTD9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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GFI1BQ5VTD9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GFI1BQ5VTD9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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