Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BEND3Q5T5X7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BEND3Q5T5X7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms