Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms