Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PERM1Q5SV97 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms