Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PIK3CD-AS1Q5SR53 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms