Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSD17B12Q53GQ0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms