Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C4orf17Q53FE4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf17Q53FE4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms