Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM259Q4ZIN3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms