Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N0

GGTA1P, Inactive N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1PQ4G0N0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GGTA1PQ4G0N0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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