Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ANKRD55Q3KP44 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ANKRD55Q3KP44 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms