Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EDRF1Q3B7T1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EDRF1Q3B7T1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms