Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWISTNBQ3B726 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWISTNBQ3B726 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms