Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C17orf58Q2M2W7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms