Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RTL8BQ17RB0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RTL8BQ17RB0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RTL8BQ17RB0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RTL8BQ17RB0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RTL8BQ17RB0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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