Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FXNQ16595 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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FXNQ16595 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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FXNQ16595 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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FXNQ16595 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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FXNQ16595 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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FXNQ16595 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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FXNQ16595 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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FXNQ16595 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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FXNQ16595 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FXNQ16595 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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