Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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SGCAQ16586 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGCAQ16586 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms