Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS72Q15906 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS72Q15906 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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