Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NCOA1Q15788 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
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NCOA1Q15788 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
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NCOA1Q15788 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
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NCOA1Q15788 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
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NCOA1Q15788 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
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NCOA1Q15788 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCOA1Q15788 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
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