Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIP4Q15650 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms