Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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GPNMBQ14956 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GPNMBQ14956 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GPNMBQ14956 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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