Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HNF4GQ14541 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms