Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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UBE4AQ14139 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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UBE4AQ14139 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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UBE4AQ14139 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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UBE4AQ14139 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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