Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCARB2Q14108 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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