Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCINQ13939 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCINQ13939 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCINQ13939 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCINQ13939 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCINQ13939 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCINQ13939 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCINQ13939 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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CCINQ13939 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCINQ13939 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CCINQ13939 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CCINQ13939 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CCINQ13939 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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CCINQ13939 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCINQ13939 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCINQ13939 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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