Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SKP2Q13309 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SKP2Q13309 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SKP2Q13309 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SKP2Q13309 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SKP2Q13309 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SKP2Q13309 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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