Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIGQ13278 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIGQ13278 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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