Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF6Q13247 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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