Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPA4Q13156 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPA4Q13156 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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