Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms