Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1AQ13111 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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