Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MRPL28Q13084 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL28Q13084 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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