Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BNIP3Q12983 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BNIP3Q12983 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms