Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PTPRJQ12913 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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PTPRJQ12913 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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PTPRJQ12913 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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PTPRJQ12913 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTPRJQ12913 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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