Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMOD3Q0VAK6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms