Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLFN5Q08AF3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLFN5Q08AF3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms