Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE4DQ08499 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms