Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTDSPL2Q05D32 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms