Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms