Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CENPCQ03188 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CENPCQ03188 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms