Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CREMQ03060 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CREMQ03060 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CREMQ03060 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CREMQ03060 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CREMQ03060 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
CREMQ03060 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
CREMQ03060 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CREMQ03060 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CREMQ03060 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms