Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APBA1Q02410 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
APBA1Q02410 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APBA1Q02410 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APBA1Q02410 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
APBA1Q02410 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
APBA1Q02410 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APBA1Q02410 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APBA1Q02410 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APBA1Q02410 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms