Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SLC6A3Q01959 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC6A3Q01959 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms