Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DEFA6Q01524 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms