Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SCN7AQ01118 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCN7AQ01118 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms