Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNB1P98172 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB1P98172 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms