Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VLDLRP98155 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms