Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms