Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO4P61968 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO4P61968 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO4P61968 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO4P61968 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms