Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS3AP61247 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms