Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SNAP25P60880 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms